2000年合校之初，学校基本建设管理部门为基建处；2007年1月，后勤管理处与基建处合并成立校园建设处，2010年11月更名为校园建设部。职能为组织实施各项基本建设工程、编制校园总体规划和校园管理。2013年1月，学校成立后勤保障部，校园建设部原校园管理职能划归后勤管理部。

 目前校园建设部为独立正处级建制，负责校园总体规划的编制和实施，组织实施新建、改扩建及大型维修项目。

下设五个科、室，分别是：部办公室、土地资源管理中心、前期规划室、造价核算室、工程管理室。